Le siège social de la Caisse Nationale de Sécurité Sociale se trouve à Lomé en face du campus nord (Université de Lomé), non loin du groupe d’assurance GTA-C2A, entre la direction générale de la documentation nationale (DGDN), la société d’administration de la zone franche (SAZOF) et le boulevard Eyadéma.
La Caisse Nationale de Sécurité Sociale est représentée dans les cinq régions du pays, par des Divisions Régionales et dans certaines préfectures, par des Centres d’information et de paiement (CIP).